ครอบครัวที่ปริมาณมูลสัตว์สดมีอยู่อย่างพอเพียง ก็มักจะไม่มีปัญหาในการหมักเริ่มต้น เพราะสามารถรวบรวมมูลสัตว์สดมาใช้สำหรับการเริ่มต้นหมักได้โดยไม่เสียเวลา แต่บางครอบครัวก็ต้องใช้เวลาในการรวบรวมมูลสัตว์หลายวัน จึงจะได้ปริมาณพอเพียง ในรายที่ต้องใช้เวลารวบรวมมูลสัตว์สด ควรปฏิบัติ ดังนี้คือ นำมูลสัตว์สดที่ได้ แต่ละครั้งมาเทรวมลงในบ่อหมัก เติมน้ำลงไปด้วยเล็กน้อยทุกครั้ง เพื่อไม่ให้ผิวหน้าของมูลสัตว์แห้ง จะช่วยป้องกันการเกิดเชื้อราได้ เมื่อมูลสัตว์ได้ปริมาณพอเพียงแล้ว จึงเติมน้ำลงไปผสมอีกหนึ่งเท่าตัว ถ้าต้องการจะเร่งให้เกิดแก๊สชีวภาพในเวลาอันรวดเร็วกว่าปกติ สามารถทำได้โดยใช้โคลน หรือเลนจากแหล่งน้ำ หรือใช้ตะกอนที่สลายตัวแล้วจากถังส้วม เติมลงในบ่อหมักประมาณ ๑% โดยปริมาตร ก็จะช่วยทำให้การหมักมีปฏิกิริยารวดเร็วดียิ่งขึ้น แต่ถ้าทำไม่ได้ก็ไม่มีความจำเป็น
มูลสัตว์ผสมน้ำในบ่อหมัก ควรจะมีระดับต่ำกว่าท่อน้ำล้นเล็กน้อย โดยคะเนว่าเมื่อนำถังแก๊สมาคว่ำครอบลงในบ่อหมัก หรือเมื่อปิดฝาบ่อหมักแล้ว ระดับของเหลวจะเพิ่มมากขึ้นได้อีกเล็กน้อยได้ระดับของท่อน้ำล้นพอดี ทั้งนี้ก็เพื่อป้องกันไม่ให้ของเหลว